Эльчин Алекпер оглы Сафаров начал профессиональную деятельность в период масштабных преобразований российской экономики. Выпускник экономического факультета МГУ 1983 года, а также кандидат экономических наук, начал свой путь в таможенных органах еще в советское время, однако именно в 1990-е годы его деятельность приобрела особое значение, когда требовалось фактически заново выстраивать систему таможенного регулирования страны.
С 1991 по 2004 год, занимая ответственные должности в Государственном таможенном комитете и Федеральной таможенной службе, Эльчин Сафаров участвовал в создании нормативно-правовой базы, которая до сих пор определяет принципы работы таможенных органов. Под его руководством формировались механизмы таможенных платежей, ставшие важнейшим источником бюджетных доходов, а также разрабатывались ключевые положения Таможенного кодекса, внедрялись системы декларирования и контроля.

Особое значение имела работа по созданию прозрачных механизмов таможенного администрирования — системы маркировки товаров, института таможенных представителей, а также реализации различных таможенных режимов (временный ввоз, переработка, таможенный склад, магазин беспошлинной торговли и др.). Эти решения позволили значительно повысить эффективность таможенного контроля в условиях стремительного роста внешнеторгового оборота. Принимал активное участие в работе правительственных комиссий по вопросам денежно-кредитной политики, внешнеторгового и таможенно-тарифного регулирования.
После завершения государственной службы в 2004 году Эльчин Сафаров применил свои знания в корпоративном секторе, работая в структурах «Газпрома». В ООО «Газпром нефть шельф» Сафаров перешёл от задач в области регулирования товаропотоков к участию в формировании правовых основ освоения арктического шельфа. В зону ответственности Эльчина Сафарова входили также следующие задачи:
- Формирование предложений в планы нормотворческой деятельности федеральных органов исполнительной власти;
- Мониторинг и анализ новых законодательных инициатив, влияющих на нефтяную отрасль, включая шельфовые проекты;
Его работа над проектом «Приразломное» напоминала решение стратегически сложной задачи: нужно было одновременно учитывать требования налогового законодательства, экологические стандарты и особые условия арктической добычи.
Участие в подготовке более 10 нормативных актов для этого проекта показало редкую способность находить точки соприкосновения между интересами бизнеса и государства. Разработанные под его руководством поправки в законодательство о континентальном шельфе заложили основу системного подхода к регулированию арктических месторождений.
За заслуги в области государственной службы Сафаров Эльчин Алекпер оглы удостоен звания «Почётный таможенник Российской Федерации», награждён Почётной грамотой Правительства Российской Федерации, а также медалью ордена «За заслуги перед Отечеством» II степени.